目前凈化空調已經越來越廣泛的應用到各個領域，其潔凈與凈化的特性能夠充分的滿足科技日益發展的各行各業的儀器的研發、醫學領域要求高度潔凈的需求，所以我國凈化型潔凈空調的應用也越發深入。
那怎樣才能做好潔凈室凈化空調工程的設計工作，就成了亟需解決的問題。
潔凈室凈化空調工程在設計時應該注意哪些方面呢？具體方面如下：
1.潔凈室凈化空調工程在設計時，要用的空調暖通相關來設計空調系統以用于潔凈室，也要對潔凈室的保護結構和相應的使得流程的考量，否則會對潔凈室空調的使用產生大的影響。
2.確定其潔凈等級、系統劃分。空調系統工程的設計方案和投資的多少直接取決于潔凈度等級對其的影響程度，因此要結合實際使用情況與使用要求的基礎之上，對潔凈度等級不同的凈化空調系統進行分別設置，以降低能耗及投資，使該工程系統設計合理化、經濟化。
3.正壓控制。保持一定程度的正壓值是潔凈室具備的條件，其目的是不被外界環境所污染，它的原理是使凈化空調系統的送風量要比回風、排風量的總和大來實現。除了在通風管道上設置相關風量調節閥以外，還要設置正壓控制設備，如回風口處安裝空氣阻層、壓差電風量調節裝置或定量風閥。其中定量風閥考慮其安裝距離，其有效發揮作用。
4.氣流組織。潔凈室氣流組織不同于一般的空調房間，其對潔凈度有著重大的影響，應從制造工藝對潔凈度的需求出發，基于節約的原則和配合建筑物的實際使用情況來決定。
5. 消聲減振。凈化型空調系統風壓較一般空調的要高，同時發生的振動情況和噪聲的可能性也較大，應著重于解決噪聲和振動所帶來的影響，防止振動、噪音從管道中傳遞出，以滿足潔凈室的具體使用要求。
6.管道附件。凈化型空調的制作在選擇材料上，應以不容易積灰塵、方便清潔的光滑表面為選擇標準進行選材。
7.空調的維護。潔凈室空調在運行使用過程中，要定期對其溫、濕度、正壓數值、三級效率過濾裝置的積灰塵情況進行檢查，對過濾附件進行定期更換，還要對人與物進行嚴格凈化。
